RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 GOSR1O95249 250 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 YES1P07947 543 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 GKN3PP0CG01 181 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 CCKARP32238 428 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 SLC1A3P43003 542 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 ZSWIM7Q19AV6 140 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 RNF220Q5VTB9 566 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 METTL21CQ5VZV1 264 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 OR11A1Q9GZK7 315 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL9Q9P2J3 617 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 OSGIN1Q9UJX0 560 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 CORO2BQ9UQ03 480 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 TMED7Q9Y3B3 224 aa21.36■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 EVPLLA8MZ36 301 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 ANGPT2O15123 496 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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SMKR1-201ENST00000462322 TACR3P29371 465 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 CLK1P49759 484 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF311Q5JNZ3 666 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 BEND4Q6ZU67 534 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 CLIP4Q8N3C7 705 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 NFKBIDQ8NI38 313 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJA3Q96EY1 480 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 ARL5BQ96KC2 179 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA9Q9BWV2 254 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 GMEB1Q9Y692 573 aa21.35■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 CYTIPO60759 359 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 PGM3O95394 542 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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SMKR1-201ENST00000462322 DLEU7Q6UYE1 221 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF550Q7Z398 422 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 C10orf111Q8N326 155 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 CADM2Q8N3J6 435 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 PSD2Q9BQI7 771 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 IKZF5Q9H5V7 419 aa21.34■■□□□ 1.01
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF226Q9NYT6 803 aa21.34■■□□□ 1.01
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SMKR1-201ENST00000462322 CHST2Q9Y4C5 530 aa21.33■■□□□ 1.01
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SMKR1-201ENST00000462322 PRG2P13727 222 aa21.32■■□□□ 1
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SMKR1-201ENST00000462322 ARFIP2P53365 341 aa21.32■■□□□ 1
SMKR1-201ENST00000462322 OR2B6P58173 313 aa21.32■■□□□ 1
SMKR1-201ENST00000462322 GUCY1A3Q02108 690 aa21.32■■□□□ 1
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SMKR1-201ENST00000462322 KRT73Q86Y46 540 aa21.31■■□□□ 1
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM38AQ9H6F2 299 aa21.31■■□□□ 1
SMKR1-201ENST00000462322 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SMKR1-201ENST00000462322 EDARQ9UNE0 448 aa21.31■■□□□ 1
SMKR1-201ENST00000462322 TRAPPC4Q9Y296 219 aa21.31■■□□□ 1
SMKR1-201ENST00000462322 PPP3CBP16298 524 aa21.3■■□□□ 1
SMKR1-201ENST00000462322 CRYGSP22914 178 aa21.3■■□□□ 1
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