RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK6Q00534 326 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DMTNQ08495 405 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FADDQ13158 208 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENBP1Q13228 472 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TSC22D1Q15714 1073 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF550Q7Z398 422 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC103Q8IW40 242 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DPP10Q8N608 796 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF563Q8TA94 476 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF128Q8TEB7 428 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ST8SIA1Q92185 356 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 HPS1Q92902 700 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5B2Q96R09 309 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PSD2Q9BQI7 771 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PIF1Q9H611 641 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf49Q9H741 205 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FAAHO00519 579 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP8B1O43520 1251 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CYTIPO60759 359 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CTAG2O75638 210 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT34O76011 436 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MFN2O95140 757 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNGR4O95473 234 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CRHP06850 196 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 THBDP07204 575 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FESP07332 822 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 THBS1P07996 1170 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CD8BP10966 210 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 EPXP11678 715 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DRD4P21917 467 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 HTR2AP28223 471 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TACR3P29371 465 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 AQP1P29972 269 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SSTR2P30874 369 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CPOXP36551 454 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEA8P43361 318 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DIO1P49895 249 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RY4P51582 365 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 HPCAP84074 193 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MYBPHQ13203 477 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SCARB2Q14108 478 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP7Q16829 419 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SYT14P1Q58G82 188 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RABL3Q5HYI8 236 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF220Q5VTB9 566 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 REP15Q6BDI9 236 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2A2Q6IF42 318 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FCRLAQ7L513 359 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GRINAQ7Z429 371 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TREML1Q86YW5 311 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CMIPQ8IY22 773 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF511Q8NB15 262 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10A6Q8NH74 314 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM234Q8WY98 164 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf49Q96BT1 292 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF559Q9BR84 538 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGMQ9H3S5 423 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NANOGQ9H9S0 305 aa6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms