RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 CTNSO60931 367 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 IFNGP01579 166 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 TFP02787 698 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 LTBRP36941 435 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CCR5P51681 352 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF550Q7Z398 422 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CADM2Q8N3J6 435 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CT45A8P0DMV1 189 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CT45A9P0DMV2 189 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 TFPIP10646 304 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CTSEP14091 401 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 PYCR1P32322 319 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CAPZA2P47755 286 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 HCCSP53701 268 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 STX4Q12846 297 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CDK10Q15131 360 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 RAB30Q15771 203 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ARL14Q8N4G2 192 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 TEX19Q8NA77 164 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 GHSRQ92847 366 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 BEX2Q9BXY8 128 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ALG5Q9Y673 324 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 NDUFB2O95178 105 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 GPR3P46089 330 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ATP12AP54707 1039 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 NRG3P56975 720 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ERV3-1Q14264 604 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 NOXA1Q86UR1 476 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 OR4K13Q8NH42 304 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 LRFN5Q96NI6 719 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 OR2W5A6NFC9 320 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MCIDASD6RGH6 385 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GNB5O14775 395 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LANCL1O43813 399 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 IGLV3-19P01714 112 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 NPR2P20594 1047 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 BTG2P78543 158 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM63Q969Q1 353 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 WACQ9BTA9 647 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LRRN3E7EW58 273 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CD83Q01151 205 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GAS6Q14393 721 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR4C3Q8NH37 302 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 Q9N2J8 555 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 A0A087WUJ7 227 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OGG1O15527 345 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PAHP00439 452 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 INPP1P49441 399 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GGTLC2Q14390 218 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 NNATQ16517 81 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CMIPQ8IY22 773 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SGTBQ96EQ0 304 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 EFCAB7A8K855 629 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms