RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PQD3 144 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 OR2M5A3KFT3 312 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 FCMRO60667 390 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CGAP01215 116 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CRATP43155 626 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CLEC12BQ2HXU8 276 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 GTDC1Q4AE62 458 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 BEND4Q6ZU67 534 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 DPP10Q8N608 796 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ZNF610Q8N9Z0 462 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 FNDC9Q8TBE3 224 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 FIG4Q92562 907 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ROPN1LQ96C74 230 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 LRRC58Q96CX6 371 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 NDE1Q9NXR1 346 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R1Q9NYW7 299 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 SLAMF8Q9P0V8 285 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 WDR45Q9Y484 360 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 DTNAQ9Y4J8 743 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 USF3Q68DE3 2245 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 HEATR5AQ86XA9 2040 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 A0A096LPI6 279 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 FXYD1O00168 92 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 HMGN4O00479 90 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 OIP5O43482 229 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 KRT75O95678 551 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 OPN1LWP04000 364 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 UBL4AP11441 157 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 B3GALT5-AS1P59052 145 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 PSME3P61289 254 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 TNK1Q13470 666 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CHRFAM7AQ494W8 412 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 COX20Q5RI15 118 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 DEFB107AQ8IZN7 70 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 MIPOL1Q8TD10 442 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 IGFBPL1Q8WX77 278 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 PLPPR2Q96GM1 343 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 RNF145Q96MT1 663 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 BTBD10Q9BSF8 475 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 SLC6A13Q9NSD5 602 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 MED17Q9NVC6 651 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ADA2Q9NZK5 511 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 VAPAQ9P0L0 249 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 LAMP3Q9UQV4 416 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 GPR52Q9Y2T5 361 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WZY1 265 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 SERINC4A6NH21 518 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 H0YC42 278 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 KLF4O43474 513 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CD5LO43866 347 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 KIAA0513O60268 411 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 SYNGR4O95473 234 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 H6PDO95479 791 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CSTAP01040 98 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 NR2F1P10589 423 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ZNF17P17021 662 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 IL11P20809 199 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ME2P23368 584 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 P2RX1P51575 399 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CLDN15P56746 228 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CLDN20P56880 219 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP1-1Q07627 177 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 FUT5Q11128 374 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 FOXF1Q12946 379 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 SYPL1Q16563 259 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 KLHL26Q53HC5 615 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 PDSS1Q5T2R2 415 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD34AQ69YU3 496 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms