RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OR2T33Q8NG76 320 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PSMF1Q92530 271 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FGF11Q92914 225 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RNF32Q9H0A6 362 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 IL17BQ9UHF5 180 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 IMPA2O14732 288 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ADAM11O75078 769 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OR7A10O76100 309 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFB2O95178 105 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CLPTM1O96005 669 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CRHBPP24387 322 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SLC6A6P31641 620 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TTKP33981 857 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GRK5P34947 590 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PTGDSP41222 190 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 NR1H2P55055 460 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 EFNB1P98172 346 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 Q0VFX4 171 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 IL10RAQ13651 578 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ATP1A4Q13733 1029 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 LNX2Q8N448 690 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 HAS2Q92819 552 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RFKQ969G6 155 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MYDGFQ969H8 173 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 DDIT4LQ96D03 193 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 AGAP4Q96P64 663 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FN3KQ9H479 309 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 DUSP21Q9H596 190 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FKRPQ9H9S5 495 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 NANSQ9NR45 359 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 POLHQ9Y253 713 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MPDZO75970 2070 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ADAM10O14672 748 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SNPHO15079 494 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ARPC3O15145 178 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OIP5O43482 229 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CLIC3O95833 236 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PEPDP12955 493 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 LIFP15018 202 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PRKCAP17252 672 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 HK1P19367 917 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MAKP20794 623 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FUT4P22083 530 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ITGA3P26006 1051 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PCYT1AP49585 367 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SNAPC1Q16533 368 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL22Q53GT1 634 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 EMC4Q5J8M3 183 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GALNT16Q8N428 558 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OR2M3Q8NG83 312 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms