RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 FHL5Q5TD97 284 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 MTFR2Q6P444 385 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ZAR1Q86SH2 424 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4N4Q8N0Y3 316 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TOMM5Q8N4H5 51 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10G6Q8NH81 332 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2M4Q96R27 311 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A7Q9Y694 548 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 FANCMQ8IYD8 2048 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF17O60258 216 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SC5DO75845 299 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SYPP08247 313 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC2A5P22732 501 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 GIFP27352 417 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 PLAURQ03405 335 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM52Q8NDY8 209 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51L1Q8NGJ5 315 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 PTCHD1Q96NR3 888 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 GHITMQ9H3K2 345 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 STMN3Q9NZ72 180 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ING4Q9UNL4 249 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TCRBP04435 133 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRG2P18507 467 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CD53P19397 219 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRA3P34903 492 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP78Q5JTW2 689 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SIAH3Q8IW03 269 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SCMH1Q96GD3 660 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 MGAT4AQ9UM21 535 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP8B1Q9UNU6 501 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM5Q9Y2B1 443 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM10L1P0DMW3 83 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ATF1P18846 271 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CCR6P51684 374 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SRP54P61011 504 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 C19orf57Q0VDD7 668 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5T3Q8NGG3 340 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 PATE1Q8WXA2 126 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1E3Q8WZA6 343 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM3CQ92520 227 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 YIPF5Q969M3 257 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TM4SF19Q96DZ7 209 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM10Q96HG1 83 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM27Q9HBJ8 222 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCL3P19876 107 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 NRG3P56975 720 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 PRRT3Q5FWE3 981 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM209AQ5JX71 171 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CDRT4Q8N9R6 151 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 IL21RQ9HBE5 538 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 BRD7Q9NPI1 651 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf66A4D0T2 115 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 PTP4A3O75365 173 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CT62P0C5K7 136 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 UQCRC1P31930 480 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP22Q9NRW4 184 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 FLRT3Q9NZU0 649 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 GNB5O14775 395 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 MBTPS2O43462 519 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM109AQ8N4B1 249 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 SDR9C7Q8NEX9 313 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 BEST4Q8NFU0 473 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 THAP4Q8WY91 577 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ORAI3Q9BRQ5 295 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNG6Q9BXT2 260 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM168Q9H0V1 697 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51J1Q9H342 316 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFP64Q9NPA5 681 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 SATB2Q9UPW6 733 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PQ72 361 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTR1BP42025 376 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTR1AP61163 376 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 FCRL6Q6DN72 434 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS45Q7RTY3 260 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 IZUMO1Q8IYV9 350 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52E2Q8NGJ4 325 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms