RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 OGG1O15527 345 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 RDH16O75452 317 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 NDUFB2O95178 105 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 IGF2P01344 180 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 OR2T7P0C7T2 308 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 NPR2P20594 1047 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ALAS2P22557 587 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 THBS2P35442 1172 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ACTA2P62736 377 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ACTG2P63267 376 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 IDNKQ5T6J7 187 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 B3GLCTQ6Y288 498 aa21.88■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 FRMD1Q8N878 549 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 OR2T27Q8NH04 317 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 OR51A7Q8NH64 312 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CHRNA9Q9UGM1 479 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 DNAH14Q0VDD8 3507 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TRAV27A0A087WT01 109 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 A0A0B4J293 547 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa21.87■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 IGHV4-34P06331 123 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 GALNSP34059 522 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 INPP1P49441 399 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 BLKP51451 505 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ATP12AP54707 1039 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 DMWDQ09019 674 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 BIKQ13323 160 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TSSK4Q6SA08 328 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 NR2C2APQ86WQ0 139 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 AVL9Q8NBF6 648 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 RIT1Q92963 219 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 RNF31Q96EP0 1072 aa21.87■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 RNF170Q96K19 258 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 PGLYRP3Q96LB9 341 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 EXTL2Q9UBQ6 330 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ORC5O43913 435 aa21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 BTG1P62324 171 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 SFXN4Q6P4A7 337 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ARL9Q6T311 187 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TAF8Q7Z7C8 310 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 NOXA1Q86UR1 476 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ZNF440Q8IYI8 595 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 OR9A4Q8NGU2 314 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 GRHL3Q8TE85 626 aa21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 PHYHIPQ92561 330 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CREB3L1Q96BA8 519 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 C4orf36Q96KX1 117 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TPSD1Q9BZJ3 242 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 SLC19A3Q9BZV2 496 aa21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 EML5Q05BV3 1969 aa21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF2O60811 474 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TMEM127O75204 238 aa21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 PTNP21246 168 aa21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 IGKV1D-16P01601 117 aa21.85■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 FAM53BQ14153 422 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TATDN3Q17R31 274 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FAAH2Q6GMR7 532 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 SGTBQ96EQ0 304 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FAM60AQ9NP50 221 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 RABL2BQ9UNT1 228 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 A0A0G2JK05 382 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CENPBD1B2RD01 187 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 E9PI62 339 aa21.84■■□□□ 1.09
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