RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 CD6P30203 668 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HOXC13P31276 330 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SQSTM1Q13501 440 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 BATFQ16520 125 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 C18orf63Q68DL7 685 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF546Q86UE3 836 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MKXQ8IYA7 352 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR1A2Q9Y585 309 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RAB6AP20340 208 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OPCMLQ14982 345 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SGK3Q96BR1 496 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR10A5Q9H207 317 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR10A2Q9H208 303 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CHRDQ9H2X0 955 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HRH4Q9H3N8 390 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PLSCR5A0PG75 271 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CPNE6O95741 557 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HBE1P02100 147 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 CCL5P13501 91 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HLA-DMAP28067 261 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RAB5CP51148 216 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CXADRP78310 365 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NFATC4Q14934 902 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OXA1LQ15070 435 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 P2RY14Q15391 338 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 A8MVM7 634 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 IGHEP01854 428 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 IL1RNP18510 177 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RAB3AP20336 220 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MMP12P39900 470 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PCBD1P61457 104 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 MANEALQ5VSG8 457 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 C4orf36Q96KX1 117 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC6A19Q695T7 634 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.3□□□□□ -1.08
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