RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00114Q6XXX2 140 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 DTX3Q8N9I9 347 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OR52E2Q8NGJ4 325 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 STARD5Q9NSY2 213 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OGG1O15527 345 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 RDH16O75452 317 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 TNFP01375 233 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ACTA2P62736 377 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ACTG2P63267 376 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ZSWIM7Q19AV6 140 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF550Q7Z398 422 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 PBX4Q9BYU1 374 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 CHRNA9Q9UGM1 479 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ADAM11O75078 769 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFB2O95178 105 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ULK3Q6PHR2 472 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZSR6 202 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 SYS1Q8N2H4 156 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 POMGNT2Q8NAT1 580 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 GPBAR1Q8TDU6 330 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ABHD1Q96SE0 405 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PRG6 482 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OR2T7P0C7T2 308 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 S1PR1P21453 382 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OR2T27Q8NH04 317 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GVC2 190 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 A6NIN4 97 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV1D-16P01601 117 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 TP53I3Q53FA7 332 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ABRACLQ9P1F3 81 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 NOTOA8MTQ0 251 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ALX3O95076 343 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 DHFRP00374 187 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 PBX2P40425 430 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 GGTLC2Q14390 218 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 FGFBP1Q14512 234 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 NTRK2Q16620 822 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 CADM2Q8N3J6 435 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 SDR9C7Q8NEX9 313 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OR13C5Q8NGS8 318 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OR4K13Q8NH42 304 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 THAP4Q8WY91 577 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 SMIM19Q96E16 107 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ICAM5Q9UMF0 924 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 A0A0G2JNG1 304 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 KIR2DS3K7RE56 304 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ARL6IP5O75915 188 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 TFP02787 698 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 GDI2P50395 445 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 TPMTP51580 245 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 KIR2DS5Q14953 304 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 CDK5R1Q15078 307 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF141Q15928 474 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OOSP2Q86WS3 158 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OR4N2Q8NGD1 307 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OR9A4Q8NGU2 314 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 SGTBQ96EQ0 304 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 GSDMCQ9BYG8 508 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 F5P12259 2224 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 OR5K4A6NMS3 321 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 EVI2BP34910 448 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 BTCP35070 178 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 GPR143P51810 404 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 PITPNAQ00169 270 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 LGALS3BPQ08380 585 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 RFLNBQ8N5W9 214 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 PELI1Q96FA3 418 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 DPAGT1Q9H3H5 408 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD13-201ENST00000392539 CD1AP06126 327 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 HCCSP53701 268 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 HYAL1Q12794 435 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM31Q5JXX7 168 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 KIRREL2Q6UWL6 708 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 KRT74Q7RTS7 529 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 SLC35F2Q8IXU6 374 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 ARL14Q8N4G2 192 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 OR5H6Q8NGV6 325 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 SLC37A2Q8TED4 501 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 DEDD2Q8WXF8 326 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 MFRPQ9BY79 579 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 FLRT2O43155 660 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 UBL3O95164 117 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD13-201ENST00000392539 GALK2Q01415 458 aa24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms