RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 C22orf15Q8WYQ4 148 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRC39Q96DD0 335 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAHD2AQ96GK7 314 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 MUS81Q96NY9 551 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SUCNR1Q9BXA5 334 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 RACGAP1Q9H0H5 632 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 NMRAL1Q9HBL8 299 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 EQTNQ9NQ60 294 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC17A5Q9NRA2 495 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 CA10Q9NS85 328 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 ASB6Q9NWX5 421 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 MED29Q9NX70 200 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 TREM2Q9NZC2 230 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 MALT1Q9UDY8 824 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 NOTCH1P46531 2555 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM129A0AVI4 362 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 GJE1A6NN92 205 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF716A6NP11 495 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SYCE1LA8MT33 242 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 E7ESA3 106 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 hCG_2039718K7EN88 272 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLF11O14901 512 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCDH7O60245 1069 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDE5AO76074 875 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 NKX2-2O95096 273 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 KCNH1O95259 989 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 PNPP00491 289 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 FSHBP01225 129 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 GSNP06396 782 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 DBHP09172 617 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 GAAP10253 952 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACP2P11117 423 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 DDX5P17844 614 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC7A1P30825 629 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SSTR1P30872 391 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 CALCRP30988 508 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 MPIP34949 423 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 RBMXP38159 391 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 GP5P40197 560 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 MAP3K8P41279 467 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 KHKP50053 298 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 ARL4CP56559 192 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 LMO4P61968 165 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 IL1RL1Q01638 556 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SELENBP1Q13228 472 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADRM1Q16186 407 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 NDUFAF6Q330K2 333 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPATS1Q496A3 300 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 GGTA1PQ4G0N0 100 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 ELFN2Q5R3F8 820 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 UGT2A3Q6UWM9 527 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 RAPH1Q70E73 1250 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 CDK20Q8IZL9 346 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 BPIFB2Q8N4F0 458 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR4F6Q8NGB9 312 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR51F2Q8NH61 342 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 FBXO30Q8TB52 745 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 C16orf78Q8WTQ4 265 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 SELENOMQ8WWX9 145 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 APH1AQ96BI3 265 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRC58Q96CX6 371 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 ELP4Q96EB1 424 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 DNAJA3Q96EY1 480 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 APIPQ96GX9 242 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR5B2Q96R09 309 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 BBS4Q96RK4 519 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-398P-201ENST00000384143 DOK1Q99704 481 aa4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms