RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 NUP107P57740 925 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 GINS1Q14691 196 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ZNF227Q86WZ6 799 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ENTHD1Q8IYW4 607 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ST8SIA1Q92185 356 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SLC19A3Q9BZV2 496 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TBC1D23Q9NUY8 699 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 IMPAD1Q9NX62 359 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 LRFN1Q9P244 771 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TMED7Q9Y3B3 224 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CH25HO95992 272 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CD96P40200 585 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CASRP41180 1078 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CDC42P60953 191 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 EGR4Q05215 589 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SPINK14Q6IE38 97 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 PLCZ1Q86YW0 608 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 C10orf53Q8N6V4 93 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 PSD4Q8NDX1 1056 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 OR51A7Q8NH64 312 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 FANK1Q8TC84 345 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ADNPQ9H2P0 1102 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SACM1LQ9NTJ5 587 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 PLA2G3Q9NZ20 509 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 DCHS1Q96JQ0 3298 aa24.34■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TRAV27A0A087WT01 109 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SHISA8B8ZZ34 492 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SUSD5O60279 629 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CDK5R2Q13319 367 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SLX4IPQ5VYV7 408 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 OAFQ86UD1 273 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ADGRG3Q86Y34 549 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 FADS6Q8N9I5 356 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 KCNE4Q8WWG9 221 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 OSTF1Q92882 214 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 FGF11Q92914 225 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 RELTQ969Z4 430 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 DNAJA3Q96EY1 480 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SAMD8Q96LT4 415 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TSSK6Q9BXA6 273 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 GPR83Q9NYM4 423 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CDH10Q9Y6N8 788 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ANKRD33BA6NCL7 494 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SLC25A12O75746 678 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 HTR3AP46098 478 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 GIPRP48546 466 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 DNASE1L1P49184 302 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 FOXF1Q12946 379 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TUBA3CQ13748 450 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TUBA3EQ6PEY2 450 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 DEPDC4Q8N2C3 294 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 LRRC17Q8N6Y2 441 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 PTGES2Q9H7Z7 377 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 HHATLQ9HCP6 504 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 IL20Q9NYY1 176 aa24.33■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 A0A0G2JMM0 328 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 A0A1W2PPB8 328 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 A0A1W2PRS3 328 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 TMEM72A0PK05 275 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 KIR3DP1A8MWS1 328 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 WDPCPO95876 746 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 C6orf141Q5SZD1 244 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 BROXQ5VW32 411 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 LAIR2Q6ISS4 152 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 ACSM5Q6NUN0 579 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 OR1J4Q8NGS1 313 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 FBLIM1Q8WUP2 373 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 GNRHR2Q96P88 292 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 OR52D1Q9H346 318 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 ZNF226Q9NYT6 803 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 POLHQ9Y253 713 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 AKAP13Q12802 2813 aa24.32■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 SNPHO15079 494 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 KLK10O43240 276 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 SNX4O95219 450 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 SMSP52788 366 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 CDK5Q00535 292 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 CDC20Q12834 499 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 PLPPR5Q32ZL2 321 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 SLC27A4Q6P1M0 643 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 CASP12Q6UXS9 341 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 NTNG2Q96CW9 530 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 ZNF696Q9H7X3 374 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 TVP23BQ9NYZ1 205 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 WASF3Q9UPY6 502 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 SIGLEC7Q9Y286 467 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 OR7A10O76100 309 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 FMO3P31513 532 aa24.31■■□□□ 1.48
MSX1-201ENST00000382723 FXYD6P3P58550 94 aa24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms