RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CITO14578 2027 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5H14A6NHG9 310 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF726A6NNF4 738 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RDH16O75452 317 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 JMJD7P0C870 316 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 S100A2P29034 98 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RGS6P49758 472 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BLKP51451 505 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CBWD6Q4V339 395 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CHSY1Q86X52 802 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FRMD1Q8N878 549 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 EXD3Q8N9H8 876 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GRHL3Q8TE85 626 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SFRP2Q96HF1 295 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ATF6BQ99941 703 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 APOL4Q9BPW4 351 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT9Q9BW91 350 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR14Q9BWN1 585 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCG5Q9H222 651 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KAT6AQ92794 2004 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf172C9J069 976 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MYL12BO14950 172 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SH3BGRLO75368 114 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CD2P06729 351 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RPA2P15927 270 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ADCYAP1P18509 176 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MYL12AP19105 171 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PSEN2P49810 448 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 UCP2P55851 309 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HSD11B2P80365 405 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MESP2Q0VG99 397 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MSS51Q4VC12 460 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KCTD1Q719H9 257 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 UNC93AQ86WB7 457 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PTOV1Q86YD1 416 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SKA3Q8IX90 412 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4K15Q8NH41 348 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIP11Q15643 1979 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PR48 441 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MGAT4DA6NG13 374 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HHLA1C9JL84 531 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EQM0 130 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MANBAO00462 879 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 EI24O14681 340 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR32O75388 356 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 UROSP10746 265 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CD72P21854 359 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BRS3P32247 399 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ARF6P62330 175 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB11AP62491 216 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB11BQ15907 218 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 UQCC3Q6UW78 93 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 APCDD1Q8J025 514 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GHDCQ8N2G8 530 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM12Q96EX1 92 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF607Q96SK3 696 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CPXM1Q96SM3 734 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PAFAH2Q99487 392 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ANHXE9PGG2 379 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R233 179 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 IFNA17P01571 189 aa6.3□□□□□ -1.4
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