RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPL17P18621 184 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COMTP21964 271 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBLN1P23435 193 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPL13P26373 211 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CERS1P27544 350 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR1D2P34982 312 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PGM1P36871 562 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HTR2BP41595 481 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHN2P52757 468 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFNA5P52803 228 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COPS2P61201 443 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF90Q03938 601 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEPT6Q14141 434 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM187Q14656 261 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CASP8Q14790 479 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEPT2Q15019 361 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DDR2Q16832 855 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBRG1Q3YBR2 411 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C4orf48Q5BLP8 95 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MESTQ5EB52 335 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MCTP2Q6DN12 878 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR5M10Q6IEU7 315 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIGA2Q7L4E1 593 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OTOP3Q7RTS5 596 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR86Q86TI4 376 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC9B2Q86UD5 537 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SGMS1Q86VZ5 419 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DENND1CQ8IV53 801 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR4N4Q8N0Y3 316 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 THEM5Q8N1Q8 247 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PQLC1Q8N2U9 271 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RDH13Q8NBN7 331 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCNYQ8ND76 341 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR4M1Q8NGD0 313 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR4C3Q8NH37 302 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUN5Q8TC36 379 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC107Q8WV48 283 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD49Q8WVL7 239 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM37Q8WXS4 190 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHC3Q92529 594 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAMM41Q96BW9 452 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNH8Q96L42 1107 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJC30Q96LL9 226 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C9orf85Q96MD7 179 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OXGR1Q96P68 337 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RMDN3Q96TC7 470 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCL19Q99731 98 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIMREGQ9BSJ6 248 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MARVELD1Q9BSK0 173 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZYG11BQ9C0D3 744 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NARFLQ9H6Q4 476 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITM2CQ9NQX7 267 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTPS2Q9NRF8 586 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 B4GALT6Q9UBX8 382 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDRG3Q9UGV2 375 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP47Q96K76 1375 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 LY75O60449 1722 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITSN1Q15811 1721 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFT172Q9UG01 1749 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A087WWV3 80 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACOD1A6NK06 481 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF727A8MUV8 499 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CES2O00748 559 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HS3ST1O14792 307 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCP110O43303 1012 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPAG6O75602 509 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDE5AO76074 875 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLCEO94923 617 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BMP10O95393 424 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HLA-DRB1P01911 266 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNB3P16520 340 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF24P17028 368 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AMD1P17707 334 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SDC1P18827 310 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLCN7P51798 805 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPK10P53779 464 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEXNQ0ZGT2 675 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMD2Q13200 908 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WTAPQ15007 396 aa-4.21□□□□□ -3.08
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