RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD3Q8WU67 409 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM234Q8WY98 164 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 VPS33AQ96AX1 596 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FAM107BQ9H098 131 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf49Q9H741 205 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SAR1AQ9NR31 198 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GID8Q9NWU2 228 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GMEB1Q9Y692 573 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PNR3 127 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPR1 153 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN24A6NM45 220 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf58C9J3I9 102 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CLIC1O00299 241 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SIAH2O43255 324 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ATE1O95260 518 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 RAF1P04049 648 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CHRM4P08173 479 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 NR2F1P10589 423 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 NID1P14543 1247 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 UQCRBP14927 111 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CRYGSP22914 178 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 RYKP34925 604 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CRATP43155 626 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 MNAT1P51948 309 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SEC24CP53992 1094 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CRISP3P54108 245 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SESN3P58005 492 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PLAURQ03405 335 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CHRNEQ04844 493 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 COX20Q5RI15 118 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 BEND4Q6ZU67 534 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 STK32CQ86UX6 486 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 KRT73Q86Y46 540 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CMIPQ8IY22 773 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF563Q8TA94 476 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf82Q8WW14 230 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ZG16BQ96DA0 208 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 OR5B2Q96R09 309 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 FOXC2Q99958 501 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 GP6Q9HCN6 339 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 FANCFQ9NPI8 374 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ACER3Q9NUN7 267 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 AGAP5A6NIR3 686 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 AP3D1O14617 1153 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PRKD3O94806 890 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 FAM107AO95990 144 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 FESP07332 822 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 BMP2P12643 396 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ETFAP13804 333 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PPP3CBP16298 524 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 IL7RP16871 459 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 DRD4P21917 467 aa6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ENPP1P22413 925 aa6.82□□□□□ -1.32
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