RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1B0GVT2 93 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PQF6 199 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 MCIDASD6RGH6 385 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 MEN1O00255 615 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CYR61O00622 381 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ARHGEF9O43307 516 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 BRINP1O60477 761 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SELENOFO60613 162 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PTP4A3O75365 173 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CBX7O95931 251 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GAAP10253 952 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HOXB2P14652 356 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF3P17036 446 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RAB3BP20337 219 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 F8A1P23610 371 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GIFP27352 417 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FHL1Q13642 323 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ERV3-1Q14264 604 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ABHD13Q7L211 337 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CDK20Q8IZL9 346 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CA13Q8N1Q1 262 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 BMFQ96LC9 184 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DERL3Q96Q80 235 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GON7Q9BXV9 100 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 MED28Q9H204 178 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 BRD7Q9NPI1 651 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 WBP1LQ9NX94 342 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GDE1Q9NZC3 331 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GNG8Q9UK08 70 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 COPS3Q9UNS2 423 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0B4J2E0 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1B0GX12 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 A6NCN8 305 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ACOD1A6NK06 481 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 H3BSH0 61 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SC5DO75845 299 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GPR75O95800 540 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 EGFP01133 1207 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ATP1B1P05026 303 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TYRP1P17643 537 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HK1P19367 917 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DRD5P21918 477 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GALP22466 123 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 UQCRC1P31930 480 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PBX2P40425 430 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NRG3P56975 720 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NFATC4Q14934 902 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KIR2DS3Q14952 304 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ALG11Q2TAA5 492 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HES5Q5TA89 166 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 STPG1Q5TH74 334 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PXKQ7Z7A4 578 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 THAP4Q8WY91 577 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HERVK_113Q902F9 699 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PIGKQ92643 395 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 YIPF5Q969M3 257 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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