RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 MICU1Q9BPX6 476 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-201ENST00000299314 MYH3P11055 1940 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-201ENST00000299314 OIP5O43482 229 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB4AP20338 218 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SSX2Q16385 188 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5H6Q8NGV6 325 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC46Q96FV0 321 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SFXN2Q96NB2 322 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 PEX14O75381 377 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SCG5P05408 212 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CPMP14384 443 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 PLK5Q496M5 336 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6F1Q8NGZ6 308 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 EHFQ9NZC4 300 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 NME7Q9Y5B8 376 aa22.58■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 DBHP09172 617 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 XCR1P46094 333 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB5CP51148 216 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCXD3Q63HM9 321 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 BADQ92934 168 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 MIB2Q96AX9 1013 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 OSGIN1Q9UJX0 560 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0D9SG52 128 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 OR7A17O14581 309 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SURF4O15260 269 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 DPM1O60762 260 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 RGRP47804 291 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE7AQ13946 482 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC9A3R2Q15599 337 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 Q6ZSR6 202 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 PTTG3PQ9NZH4 202 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 LUZP4Q9P127 313 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 NENFQ9UMX5 172 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 BMPR1AP36894 532 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 STEAP3Q658P3 488 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CPXM2Q8N436 756 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 B4DXG7 233 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 MPPED1O15442 326 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 AQP9O43315 295 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 PTHP01270 115 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF28P17035 718 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 EFNA3P52797 238 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 EMP2P54851 167 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ACY1Q03154 408 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ALKAL2Q6UX46 152 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 COX15Q7KZN9 410 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC14AQ86T13 490 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CRB3Q9BUF7 120 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6C65A6NJZ3 312 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 NFATC4Q14934 902 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 OR7E24Q6IFN5 339 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.29e-8■■■■□ 24.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 FADS1O60427 444 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CNMDO75829 334 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 PLGLAQ15195 96 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4K15Q8NH41 348 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 MED20Q9H944 212 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 OPRD1P41143 372 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 C18orf63Q68DL7 685 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 HBMQ6B0K9 141 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ADOQ96SZ5 270 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPOQ9BU64 300 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB9BQ9NP90 201 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 MED17Q9NVC6 651 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 TSTD3H0UI37 97 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 C1SP09871 688 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 PKLRP30613 574 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 LACC1Q8IV20 430 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 RSC1A1Q92681 617 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF25Q9UIL4 384 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 HIDE1A8MVS5 230 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 HTR3DQ70Z44 454 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL5BQ96KC2 179 aa22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms