RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 DHDHQ9UQ10 334 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SCO2O43819 266 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF20P17024 532 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 S100PBPQ96BU1 408 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 V9GYH0 126 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TMEM129A0AVI4 362 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 KNG1P01042 644 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SOX9P48436 509 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PER3P56645 1201 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SIRPAP78324 504 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SPOCK1Q08629 439 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 DCUN1D4Q92564 292 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 HAVCR1Q96D42 359 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RNF170Q96K19 258 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.61□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RD3LP0DJH9 198 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 S100A11P31949 105 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RAP2BP61225 183 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ATF6BQ99941 703 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MS4A8Q9BY19 250 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 WRBO00258 174 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ADAMTS4O75173 837 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 IGFALSP35858 605 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TMEM106AQ96A25 262 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TEAD3Q99594 435 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 VEGFDO43915 354 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 S1PR1P21453 382 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 HTR1FP30939 366 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MTNR1BP49286 362 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 LTBQ06643 244 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RAB33AQ14088 237 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 C17orf99Q6UX52 265 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 DEFB119Q8N690 84 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 GPR171O14626 319 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SGCEO43556 437 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 OPN1LWP04000 364 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 GDI1P31150 447 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 AANATQ16613 207 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 LCTLQ6UWM7 567 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 GPAT4Q86UL3 456 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 EMC7Q9NPA0 242 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 H3BNC9 293 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PEX12O00623 359 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 FZD6O60353 706 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 IGLV3-27P01718 113 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.9 ms