RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 FOLR3P41439 243 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB133Q30KQ1 61 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR13C2Q8NGS9 318 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T7P0C7T2 308 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 UBBP0CG47 229 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PVRP15151 417 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 FUNDC1Q8IVP5 155 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T27Q8NH04 317 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PTHP01270 115 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 IGHG1P01857 330 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DMAP28067 261 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH3B1P43353 468 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 FCRLAQ7L513 359 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR6F1Q8NGZ6 308 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ATPIF1Q9UII2 106 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 AP1G1O43747 822 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 APLNRP35414 380 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SQSTM1Q13501 440 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP7Q16829 419 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 APOOLQ6UXV4 268 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ZFAND1Q8TCF1 268 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 EPHX3Q9H6B9 360 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NPAP1Q9NZP6 1156 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 GPX2P18283 190 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RAB38P57729 211 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A6Q4U2R8 563 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NXNL2Q5VZ03 156 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP8Q86W28 1048 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR6V1Q8N148 313 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR4M1Q8NGD0 313 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD5Q8WTS1 349 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NEURL3Q96EH8 262 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PSD2Q9BQI7 771 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ASIC5Q9NY37 505 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 FAM227AF5H4B4 570 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 H0YGG7 62 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 GABARAPO95166 117 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CLVS2Q5SYC1 327 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A8Q9BY19 250 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PEX14O75381 377 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CASP6P55212 293 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-16P61578 105 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR7E24Q6IFN5 339 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM38AQ9H6F2 299 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF264O43296 627 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A11P48066 632 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SPOCK1Q08629 439 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 POU4F3Q15319 338 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFB2Q8N4F0 458 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 STK35Q8TDR2 534 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 A4GALTQ9NPC4 353 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CD63P08962 238 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MTNR1BP49286 362 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 LCN10Q6JVE6 187 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ENTHD1Q8IYW4 607 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 C1GALT1Q9NS00 363 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM100Q9NV29 134 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RGPD1P0DJD0 1748 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CR2P20023 1033 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CASP3P42574 277 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ8Q15842 424 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf46Q6UWT4 87 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TOX2Q96NM4 488 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 DPM1O60762 260 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MPEG1Q2M385 716 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM212A6NML5 194 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZFAND5O76080 213 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MSX1P28360 303 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 YPEL5P62699 121 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 UBA52P62987 128 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SIRPAP78324 504 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 REEP5Q00765 189 aa19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms