RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 RPE65Q16518 533 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 GALNT10Q86SR1 603 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 BPIFCQ8NFQ6 507 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR1J1Q8NGS3 322 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RNF128Q8TEB7 428 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF566Q969W8 418 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SUSD2Q9UGT4 822 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ERI3O43414 337 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CST2P09228 141 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CLCNKAP51800 687 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ENPP2Q13822 863 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CST9LP1Q5W188 147 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 BPIFB2Q8N4F0 458 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR1J2Q8NGS2 313 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR5AK2Q8NH90 309 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 HLA-CQ95604 372 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM231Q9H6L2 316 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OARD1Q9Y530 152 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 DCTN6O00399 190 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SCDO00767 359 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 HOXB2P14652 356 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RIN1Q13671 783 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SLC35G1Q2M3R5 365 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 NAXDQ8IW45 347 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 MFSD4AQ8N468 514 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR4K1Q8NGD4 311 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 GSTO2Q9H4Y5 243 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 C1GALT1Q9NS00 363 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 GPR45Q9Y5Y3 372 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CYB5BO43169 146 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TBX18O95935 607 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 NFYBP25208 207 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 UNC5DQ6UXZ4 953 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 FAM86B1Q8N7N1 296 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RAB8BQ92930 207 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RTP4Q96DX8 246 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PCYT2Q99447 389 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR51M1Q9H341 326 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 UBQLN3Q9H347 655 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CLEC4EQ9ULY5 219 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 LRP5LA4QPB2 252 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 AQP8O94778 261 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 PCGF2P35227 344 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 PIGAP37287 484 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 RPL29P47914 159 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 EPHA4P54764 986 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CTF1Q16619 201 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SFXN4Q6P4A7 337 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 IL34Q6ZMJ4 242 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 Q6ZVU0 165 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 OR5P2Q8WZ92 322 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 PARD6AQ9NPB6 346 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 OSER1Q9NX31 292 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 GRHPRQ9UBQ7 328 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SERTAD3Q9UJW9 196 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF726A6NNF4 738 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 KNG1P01042 644 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CSF2RAP15509 400 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 KIR2DL3P43628 341 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ELOCQ15369 112 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SLC5A12Q1EHB4 618 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 NIPAL3Q6P499 406 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC190Q86UF4 302 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 OR56B1Q8NGI3 324 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF586Q9NXT0 402 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 KCNS2Q9ULS6 477 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM200CA6NKL6 621 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 PEX10O60683 326 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM35AQ53FP2 167 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 STPG2Q8N412 459 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 WDR20Q8TBZ3 569 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 DUSP21Q9H596 190 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF850A8MQ14 1090 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SYT7O43581 403 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 RAD51DO75771 328 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CLDN7O95471 211 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 OR52W1Q6IF63 320 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CBLL1Q75N03 491 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 OR52N2Q8NGI0 321 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 PROKR1Q8TCW9 393 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms