RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 CLPXO76031 633 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 NDUFB2O95178 105 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ONECUT2O95948 504 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZNF883P0CG24 379 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 HTR1FP30939 366 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC1A3P43003 542 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 MC2RQ01718 297 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 GXYLT1Q4G148 440 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 C3orf38Q5JPI3 329 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ADCK1Q86TW2 530 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 LHFPL3Q86UP9 236 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 GID4Q8IVV7 300 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 CYB561A3Q8NBI2 242 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PMEPA1Q969W9 287 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 CMKLR1Q99788 373 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC26A1Q9H2B4 701 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 A0A1W2PQD3 144 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 NADKO95544 446 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PEPDP12955 493 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZNF3P17036 446 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 HK1P19367 917 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 DGUOKQ16854 277 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR2G6Q5TZ20 316 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR51G2Q8NGK0 314 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 DUSP19Q8WTR2 217 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 LOXL4Q96JB6 756 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OPALINQ96PE5 141 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 FN3KQ9H479 309 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 BAIAP2Q9UQB8 552 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR6C70A6NIJ9 312 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 C9J4A7 227 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR7A10O76100 309 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SCG5P05408 212 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ENTPD1P49961 510 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 FBXW4P57775 412 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 DOC2BQ14184 412 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR5M10Q6IEU7 315 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC37A3Q8NCC5 494 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 GATAD2BQ8WXI9 593 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZNF524Q96C55 264 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 HCAR1Q9BXC0 346 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC19A3Q9BZV2 496 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 DCSTAMPQ9H295 470 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 FBXO8Q9NRD0 319 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 IFNGP01579 166 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 PGCP20142 388 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 CXCR1P25024 350 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 GAS1P54826 345 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 SLC26A5P58743 744 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 ITGADQ13349 1161 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 CRMP1Q14194 572 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 RNLSQ5VYX0 342 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 OR52E2Q8NGJ4 325 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 NUBPLQ8TB37 319 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 DNAJA3Q96EY1 480 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 NANSQ9NR45 359 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 C2orf72A6NCS6 295 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 MCIDASD6RGH6 385 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 ZFAND5O76080 213 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 MST1P26927 711 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 SERPINB10P48595 397 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 WNT4P56705 351 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 FHL1Q13642 323 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 EFR3AQ14156 821 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 SSX1Q16384 188 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 LIPKQ5VXJ0 399 aa13.33□□□□□ -0.28
NICN1-201ENST00000273598 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms