RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 HAS2Q92819 552 aa5.94□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 INIPQ9NRY2 104 aa5.94□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 OR52A4PA6NMU1 304 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 MED6O75586 246 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 IFNA10P01566 189 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 RAB3AP20336 220 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SLC35A2P78381 396 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 IGSF11Q5DX21 431 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF425Q6IV72 752 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF480Q8WV37 535 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ASB11Q8WXH4 323 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 TGM7Q96PF1 710 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 PDE7BQ9NP56 450 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 PGAP2Q9UHJ9 254 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ACOD1A6NK06 481 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 M0QZQ0 153 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SIX6O95475 246 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 HOXB5P09067 269 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 AOAHP28039 575 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 S100A11P31949 105 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 IRF4Q15306 451 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 PKDCCQ504Y2 493 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 MPP7Q5T2T1 576 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 HBMQ6B0K9 141 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SMIM14Q96QK8 99 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 PTTG3PQ9NZH4 202 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF236Q9UL36 1845 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 A0A0D9SG52 128 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 FAM227AF5H4B4 570 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ALX3O95076 343 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ILKQ13418 452 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 OXA1LQ15070 435 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 TEX19Q8NA77 164 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 CWH43Q9H720 699 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 A0A1W2PS29 197 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 CDHR4A6H8M9 788 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SHC1P29353 583 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF542PQ5EBM4 170 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 HORMAD2Q8N7B1 307 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.466e-7■■■■□ 25.2
SBNO1-201ENST00000267176 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SERPINA5P05154 406 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 HHEXQ03014 270 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 HTR4Q13639 388 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 PPA1Q15181 289 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 PGAP1Q75T13 922 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 HCAR1Q9BXC0 346 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 A0A0B4J2A0 478 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 CIB4A0PJX0 185 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 DDOSTP39656 456 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 TAS2R31P59538 309 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 P2RY14Q15391 338 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 GHSRQ92847 366 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SERINC2Q96SA4 455 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 INTS14Q96SY0 518 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 KCMF1Q9P0J7 381 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 VDAC3Q9Y277 283 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 F13BP05160 661 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 GABRR1P24046 479 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 CRABP1P29762 137 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 LCTLQ6UWM7 567 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM200AQ86VY9 491 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.93□□□□□ -1.46
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM106AQ96A25 262 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms