RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 SLC17A1Q14916 467 aa9.97□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 SLC10A1Q14973 349 aa9.97□□□□□ -0.81
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KPNA3-201ENST00000261667 DDNO94850 711 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 PFKMP08237 780 aa9.96□□□□□ -0.81
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