RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 KLK2P20151 261 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CD247P20963 164 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 HTR2AP28223 471 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 OPRM1P35372 400 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 HTR3AP46098 478 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SYT14P1Q58G82 188 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 PDSS1Q5T2R2 415 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 FAM91A1Q658Y4 838 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ZNF787Q6DD87 383 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 WBP2NLQ6ICG8 309 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A8Q8IWU4 369 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SMYD1Q8NB12 490 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ROBO4Q8WZ75 1007 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 STARD4Q96DR4 205 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SFXN3Q9BWM7 321 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 OR11A1Q9GZK7 315 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ENKD1Q9H0I2 346 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 TMED7Q9Y3B3 224 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 PRORSD1PA6NEY8 169 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 NME4O00746 187 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CRHP06850 196 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CCNA2P20248 432 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ5P48544 419 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 RAC3P60763 192 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 VEZF1Q14119 521 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 OR2A2Q6IF42 318 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 VWA1Q6PCB0 445 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 TMPPEQ6ZT21 453 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 C3orf49Q96BT1 292 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 OR5B2Q96R09 309 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ARL8BQ9NVJ2 186 aa19.93■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 MPDZO75970 2070 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 FAM220BPB1ANY3 271 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SYT5O00445 386 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ZNF208O43345 1280 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 LGI1O95970 557 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CGAP01215 116 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ENPP1P22413 925 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 NUDT2P50583 147 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CADM2Q8N3J6 435 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 LSMEM1Q8N8F7 131 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 OR4D11Q8NGI4 311 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 LRRC37BQ96QE4 947 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ARHGDIGQ99819 225 aa19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 UQCRBP14927 111 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A1P30825 629 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CPA2P48052 419 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CLK1P49759 484 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 DIO1P49895 249 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A2P52569 658 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 MYBPHQ13203 477 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 NRF1Q16656 503 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ERICH5Q6P6B1 374 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 BTLAQ7Z6A9 289 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 FITM2Q8N6M3 262 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 RNF128Q8TEB7 428 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 DNAJA3Q96EY1 480 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ABCD2Q9UBJ2 740 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CLEC4AQ9UMR7 237 aa19.91■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 DCHS2Q6V1P9 2916 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 DCTN3O75935 186 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SYNGR4O95473 234 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 C8BP07358 591 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 IMPDH2P12268 514 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 FCGR2AP12318 317 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 COPZ1P61923 177 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 LIPEQ05469 1076 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 BNIP2Q12982 314 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 NPTX1Q15818 432 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ARPINQ7Z6K5 226 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 MICU2Q8IYU8 434 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 OR2T12Q8NG77 320 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ABHD3Q8WU67 409 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SPOCK3Q9BQ16 436 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 PRRG4Q9BZD6 226 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 TIGARQ9NQ88 270 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 A8MXE2 369 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB7O75200 414 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PMS2P2O95744 297 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TFPIP10646 304 aa19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms