RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SULF2Q8IWU5 870 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR13H1Q8NG92 308 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MOCOSQ96EN8 888 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR14A2Q96R54 314 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PHOX2BQ99453 314 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GABARAPH6UMI1 98 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF749O43361 778 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TNFSF12O43508 249 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA0513O60268 411 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FAM189A1O60320 539 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GABARAPO95166 117 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 DNASE1P24855 282 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 THBS3P49746 956 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 RAB13P51153 203 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FAM189BP81408 668 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FXNQ16595 210 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC6A19Q695T7 634 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ISCA2Q86U28 154 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF480Q8WV37 535 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR7D2Q96RA2 312 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MRI1Q9BV20 369 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HCRTR1O43613 425 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GLCEO94923 617 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CRYZL1O95825 349 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFB7P17568 137 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TNFRSF1BP20333 461 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GPR18Q14330 331 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GPR150Q8NGU9 434 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FBXW5Q969U6 566 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CHFRQ96EP1 664 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HDAC8Q9BY41 377 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ADAM12O43184 909 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 RASAL1O95294 804 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GAAP10253 952 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC2A1P11166 492 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GGT1P19440 569 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MFAP5Q13361 173 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 AADACL3Q5VUY0 350 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GARNL3Q5VVW2 1013 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PARM1Q6UWI2 310 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR5W2Q8NH69 310 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PRRC1Q96M27 445 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 IL37Q9NZH6 218 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CPT2P23786 658 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 BDKRB2P30411 391 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MTCP1P56278 107 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SH3BP2P78314 561 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 AARDQ4LEZ3 155 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR4A16Q8NH70 328 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HCSTQ9UBK5 93 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 KIF25Q9UIL4 384 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PROCRQ9UNN8 238 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GLB1P16278 677 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TPMTP51580 245 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SELENOWP63302 87 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 COQ5Q5HYK3 327 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC22A25Q6T423 547 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CLEC14AQ86T13 490 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 INPP5KQ9BT40 448 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 DEFB127Q9H1M4 99 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 C1orf198Q9H425 327 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 H3BSA7 217 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SRFP11831 508 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms