RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CT62P0C5K7 136 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-216ENST00000628306 CD247P20963 164 aa21.84■■□□□ 1.09
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CAPNS1-216ENST00000628306 NTRK2Q16620 822 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-216ENST00000628306 TPD52L3Q96J77 140 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-216ENST00000628306 CIB1Q99828 191 aa21.84■■□□□ 1.09
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CAPNS1-216ENST00000628306 SAP130Q9H0E3 1048 aa21.84■■□□□ 1.09
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CAPNS1-216ENST00000628306 CHRM4P08173 479 aa21.83■■□□□ 1.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF441Q8N8Z8 693 aa21.83■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5K1Q8NHB7 308 aa21.83■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC29A1Q99808 456 aa21.83■■□□□ 1.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A1Q9H2H9 487 aa21.83■■□□□ 1.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD33BA6NCL7 494 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 GNGT2O14610 69 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ACP2P11117 423 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 EMDP50402 254 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 BICRALQ6AI39 1079 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 Q71RC1 249 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.82■■□□□ 1.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR52R1Q8NGF1 315 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01560Q8TB33 94 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 TMBIM1Q969X1 311 aa21.82■■□□□ 1.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 VSTM2LQ96N03 204 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 GAL3ST4Q96RP7 486 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 PINK1Q9BXM7 581 aa21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 ENPP4Q9Y6X5 453 aa21.8■■□□□ 1.08
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