RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	UPB1	Q9UBR1	384 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	FZR1	Q9UM11	496 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440		A8MZ25	164 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF879	B4DU55	563 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R2N4	97 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PDLIM1	O00151	329 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ACOX3	O15254	700 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	FZD7	O75084	574 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	GP9	P14770	177 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	NR4A1	P22736	598 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	IMPA1	P29218	277 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ELK3	P41970	407 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CHI3L2	Q15782	390 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD7	Q92527	254 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PAGE5	Q96GU1	130 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PANX3	Q96QZ0	392 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR21	Q99679	349 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ATF6B	Q99941	703 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	AICDA	Q9GZX7	198 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10A5	Q9H207	317 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	EMC3	Q9P0I2	261 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CHST1	O43916	411 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	MMP9	P14780	707 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ETS2	P15036	469 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	NTS	P30990	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PLA2G16	P53816	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	GALK2	Q01415	458 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	MPP3	Q13368	585 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	SELPLG	Q14242	412 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CYTIP	O60759	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	UBOX5	O94941	541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	WNT2	P09544	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	MPG	P29372	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	IL12B	P29460	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	GLRX	P35754	106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT20	P35900	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBA1B	P68363	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBA4A	P68366	448 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PDE7A	Q13946	482 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-223	ENST00000627440	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61

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