RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB5O15062 677 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A4O15374 487 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MSI1O43347 362 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 XRCC2O43543 280 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 KLRC4O43908 158 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ENTPD5O75356 428 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PMPCBO75439 489 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SUPT7LO94864 414 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TDP2O95551 362 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CER1O95813 267 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINE2P07093 398 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CA3P07451 260 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TRAPPC2P0DI81 140 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TRAPPC2BP0DI82 140 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ANXA3P12429 323 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MMP9P14780 707 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 IL2RBP14784 551 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 AMD1P17707 334 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 UQCRC2P22695 453 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MMP11P24347 488 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 STOMP27105 288 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CD6P30203 668 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SLC6A1P30531 599 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TIMP3P35625 211 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 COILP38432 576 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PBX1P40424 430 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CSKP41240 450 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PNPLA4P41247 253 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GRIA3P42263 894 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MATKP42679 507 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NPBWR2P48146 333 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RFX3P48380 749 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CRYBA4P53673 196 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NCALDP61601 193 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FAM3AP98173 230 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CDC42EP1Q00587 391 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 IL5RAQ01344 420 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MC2RQ01718 297 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FOLH1Q04609 750 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 C16orf72Q14CZ0 275 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TRAM1Q15629 374 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TRIP10Q15642 601 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 HLFQ16534 295 aa2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 ARRDC1Q8N5I2 433 aa2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF283Q8N7M2 679 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN22Q8N7P3 220 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 EXD3Q8N9H8 876 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR8J3Q8NGG0 315 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA22Q8NHS9 363 aa2.8□□□□□ -1.96
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