RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	BEX2	Q9BXY8	128 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	OR51I1	Q9H343	314 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	DSCAM	O60469	2012 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	GJE1	A6NN92	205 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	ALG1L2	C9J202	215 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	RFXANK	O14593	260 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	KRT34	O76011	436 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	PSMG1	O95456	288 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	IGHV4-39	P01824	125 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	NGFR	P08138	427 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	ALOX5	P09917	674 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	OR12D1	P0DN82	309 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	MATN1	P21941	496 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	VAMP1	P23763	118 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	AGTR1	P30556	359 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	LCN1	P31025	176 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	CARD18	P57730	90 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	C21orf58	P58505	322 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	VLDLR	P98155	873 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	KLF10	Q13118	480 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	ITGAD	Q13349	1161 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	TAB1	Q15750	504 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	PGGHG	Q32M88	737 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	AGAP6	Q5VW22	663 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	HBM	Q6B0K9	141 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	DTX2	Q86UW9	622 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	SNX32	Q86XE0	403 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	RNF130	Q86XS8	419 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	MISP	Q8IVT2	679 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	ZNF614	Q8N883	585 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	OSTF1	Q92882	214 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	CCDC115	Q96NT0	180 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	KCNK17	Q96T54	332 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	TRIM2	Q9C040	744 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	SAR1A	Q9NR31	198 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CS-233	ENST00000552688	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MED12L	Q86YW9	2145 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	COL6A5	A8TX70	2615 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TNFSF11	O14788	317 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ANGPT2	O15123	496 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NDUFB5	O43674	189 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CXCL13	O43927	109 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PRKD3	O94806	890 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	UTS2	O95399	124 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	IL6	P05231	212 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	YES1	P07947	543 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NUDT7	P0C024	238 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	BMP4	P12644	408 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ETFA	P13804	333 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SLC25A16	P16260	332 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	UQCRC2	P22695	453 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CDKN1A	P38936	164 aa		6.08	□□□□□ -1.44

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