RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548338.5

CNOT2-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT2, Length 355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-211ENST00000548338 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa2.1□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 ADGRB2O60241 1585 aa2.1□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 VWDEQ8N2E2 1590 aa2.1□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 REREQ9P2R6 1566 aa2.1□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa2.1□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa2.1□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 ABCA6Q8N139 1617 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 ATP10DQ9P241 1426 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 RLFQ13129 1914 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 ERCC6Q03468 1493 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 A0A1W2PPR1 153 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 XKRY2A2RUG3 117 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 LRP5LA4QPB2 252 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 GOLGA8OA6NCC3 632 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 FRG2CA6NGY1 282 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 SAGE2PA6NJ88 616 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 A8MXQ7 604 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 GOLGA8NF8WBI6 632 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 H3BMQ9 156 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 OR7A17O14581 309 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 CXCL11O14625 94 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 TM9SF1O15321 606 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 ATP5LO75964 103 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 NOL4O94818 638 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 DIRAS1O95057 198 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 AP2A1O95782 977 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 PGK1P00558 417 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 HPP00738 406 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 F10P00742 488 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 PIGRP01833 764 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 OPN1LWP04000 364 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 IGF1P05019 195 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 SLC2A3P11169 496 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 UMPSP11172 480 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 FOLR2P14207 255 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 CPN1P15169 458 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 NT5EP21589 574 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 TBXA2RP21731 343 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 CHMLP26374 656 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 GNA11P29992 359 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 TDO2P48775 406 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 CDH4P55283 916 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 PKNOX1P55347 436 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 RND3P61587 244 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 UBE2HP62256 183 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 CUL1Q13616 776 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 KCNJ11Q14654 390 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 LPAL2Q16609 132 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 GGTA1PQ4G0N0 100 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 DMRTC1Q5HYR2 192 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 FAM182AQ5T1J6 154 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 PYHIN1Q6K0P9 492 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 METTL7BQ6UX53 244 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 HSDL2Q6YN16 418 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 NLRP9Q7RTR0 991 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 HIPK1Q86Z02 1210 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 CSNK1A1LQ8N752 337 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 C17orf47Q8NEP4 570 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 OR5D13Q8NGL4 314 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 OR4D5Q8NGN0 318 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 OR2L2Q8NH16 312 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 OR1F12Q8NHA8 337 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 NANPQ8TBE9 248 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 FNDC8Q8TC99 324 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 RNF139Q8WU17 664 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 RASL10AQ92737 203 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 TOMM40LQ969M1 308 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 SLC41A3Q96GZ6 507 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 TIMD4Q96H15 378 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 SERAC1Q96JX3 654 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 CASD1Q96PB1 797 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 CENPKQ9BS16 269 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 TM2D1Q9BX74 207 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 SLITRK2Q9H156 845 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 ZNF385DQ9H6B1 395 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 AZI2Q9H6S1 392 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 YY1AP1Q9H869 796 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 MCCC2Q9HCC0 563 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 DPM3Q9P2X0 92 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 IKZF2Q9UKS7 526 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 PLLPQ9Y342 182 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa2.09□□□□□ -2.07
CNOT2-211ENST00000548338 KIF1BO60333 1816 aa2.09□□□□□ -2.08
CNOT2-211ENST00000548338 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa2.08□□□□□ -2.08
CNOT2-211ENST00000548338 PTPRTO14522 1441 aa2.08□□□□□ -2.08
CNOT2-211ENST00000548338 YEATS2Q9ULM3 1422 aa2.08□□□□□ -2.08
CNOT2-211ENST00000548338 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms