RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC63	Q05C16	580 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SPAG1	Q07617	926 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CDC20	Q12834	499 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CAMK2D	Q13557	499 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	GIT2	Q14161	759 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	FLOT2	Q14254	428 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	POU6F1	Q14863	301 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	PON2	Q15165	354 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SLC15A2	Q16348	729 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	FUT11	Q495W5	492 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	NADK2	Q4G0N4	442 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	REP15	Q6BDI9	236 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	MICU2	Q8IYU8	434 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	NECAB1	Q8N987	351 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO30	Q8TB52	745 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SAP25	Q8TEE9	199 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TLCD1	Q96CP7	247 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SLC29A1	Q99808	456 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CUEDC2	Q9H467	287 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	RMND5A	Q9H871	391 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SAR1A	Q9NR31	198 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	PARVA	Q9NVD7	372 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	VNN3	Q9NY84	501 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF221	Q9UK13	617 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SNX12	Q9UMY4	172 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	AP4S1	Q9Y587	144 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CACNG2	Q9Y698	323 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		2.96	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		2.96	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	HEATR9	A2RTY3	570 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF98	A6NK75	572 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	MEI4	A8MW99	385 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF487	B1APH4	448 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057		I3L4J1	428 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	GYG2	O15488	501 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ENTPD5	O75356	428 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	SULT1C4	O75897	302 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	RHOBTB1	O94844	696 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM16	O95361	564 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	SHBG	P04278	402 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	IL6	P05231	212 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	PGK2	P07205	417 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ICAM2	P13598	275 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	SERPINB5	P36952	375 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	TNFRSF4	P43489	277 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	RGR	P47804	291 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	NPY2R	P49146	381 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	SULT1E1	P49888	294 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	AIF1	P55008	147 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	AP1S2	P56377	157 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	IL9R	Q01113	521 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	NAB1	Q13506	487 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF846	Q147U1	533 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	NCF4	Q15080	339 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	SPA17	Q15506	151 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	DUSP7	Q16829	419 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	CEP55	Q53EZ4	464 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	HES5	Q5TA89	166 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	ARSK	Q6UWY0	536 aa		2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
COPS5-208	ENST00000519057	CHST3	Q7LGC8	479 aa		2.96	□□□□□ -1.94

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