RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 RFKQ969G6 155 aa6.88□□□□□ -1.31
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SEC31A-241ENST00000515749 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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SEC31A-241ENST00000515749 GPR87Q9BY21 358 aa6.88□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.88□□□□□ -1.31
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SEC31A-241ENST00000515749 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
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SEC31A-241ENST00000515749 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.87□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 GPA33Q99795 319 aa6.87□□□□□ -1.31
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SEC31A-241ENST00000515749 ADAM19Q9H013 955 aa6.87□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.87□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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SEC31A-241ENST00000515749 CNIH4Q9P003 139 aa6.87□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.87□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 MPDZO75970 2070 aa6.87□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.87□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 VCANP13611 3396 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 EFSO43281 561 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 IDH3BO43837 385 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 XPNPEP2O43895 674 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 SEC14L2O76054 403 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 DKK1O94907 266 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 SOX14O95416 240 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 CDK1P06493 297 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 UMODP07911 640 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 COX6A1P12074 109 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 GP1BBP13224 206 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 TCN2P20062 427 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 CD82P27701 267 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 SLC6A6P31641 620 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 ETV5P41161 510 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 SLC15A1P46059 708 aa6.86□□□□□ -1.31
SEC31A-241ENST00000515749 LIMK1P53667 647 aa6.86□□□□□ -1.31
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