RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	STS	P08842	583 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	H2BFM	P0C1H6	154 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR8U8	P0C7N1	319 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPA8	P0DM63	369 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HNF1A	P20823	631 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXD10	P28358	340 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PPT1	P50897	306 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR4	Q16378	134 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LIPN	Q5VXI9	398 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM225	Q6GV28	225 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF544	Q6NX49	715 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MOB3B	Q86TA1	216 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TPRA1	Q86W33	373 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CEND1	Q8N111	149 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284		Q8N7P7	452 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKFN1	Q8N957	763 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2T3	Q8NH03	318 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RLN3	Q8WXF3	142 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HAVCR1	Q96D42	359 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NUS1	Q96E22	293 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C7orf34	Q96L11	122 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CITED1	Q99966	193 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284		Q9H3A6	140 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PLLP	Q9Y342	182 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HECW1	Q76N89	1606 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TNR	Q92752	1358 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CPS1	P31327	1500 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PP2D1	A8MPX8	630 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SULT2B1	O00204	365 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TOM1	O60784	492 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	UGT2B17	O75795	530 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HNMT	P50135	292 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC26A2	P50443	739 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	DIO3	P55073	304 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	STX17	P56962	302 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RIPPLY3	P57055	190 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TP53I3	Q53FA7	332 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC80	Q76M96	950 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NRM	Q8IXM6	262 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM123	Q8N131	208 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CNPY3	Q9BT09	278 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RAB18	Q9NP72	206 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PTPRK	Q15262	1439 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PLA2R1	Q13018	1463 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MROH2A	A6NES4	1674 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	BTN3A3	O00478	584 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PRRG1	O14668	218 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RS1	O15537	224 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GNA14	O95837	355 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	IGHV3-23	P01764	117 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CD1E	P15812	388 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP2B6	P20813	491 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GLRA2	P23416	452 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NTS	P30990	170 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SPIB	Q01892	262 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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