RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	PDK3	Q15120	406 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CEND1	Q8N111	149 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	RAPGEF5	Q92565	580 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	NEIL2	Q969S2	332 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	FGGY	Q96C11	551 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SLITRK2	Q9H156	845 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	POLE4	Q9NR33	117 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	PHF11	Q9UIL8	331 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425		A0A1B0GUS0	222 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425		K7N7A8	449 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CXCL13	O43927	109 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	OR10H3	O60404	316 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	PFKFB2	O60825	505 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ECI2	O75521	394 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SCGN	O76038	276 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SLITRK3	O94933	977 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	LALBA	P00709	142 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	IGHV3-23	P01764	117 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ANXA13	P27216	316 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	AQP1	P29972	269 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	NTS	P30990	170 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	LEP	P41159	167 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC26A2	P50443	739 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CHRNB3	Q05901	458 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	RIPK1	Q13546	671 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ISX	Q2M1V0	245 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CEP55	Q53EZ4	464 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	BEND3	Q5T5X7	828 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	LCA5	Q86VQ0	697 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SVOPL	Q8N434	492 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	FBXL16	Q8N461	479 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	OR56B4	Q8NH76	319 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	MARC2	Q969Z3	335 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	TBX15	Q96SF7	602 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF670	Q9BS34	389 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CNPY3	Q9BT09	278 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SMOX	Q9NWM0	555 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CDH9	Q9ULB4	789 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	EPOP	A6NHQ4	379 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ZFP92	A6NM28	416 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425		E7ENQ6	273 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	HAT1	O14929	419 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF264	O43296	627 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	SEMG1	P04279	462 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	GRIA1	P42261	906 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	BID	P55957	195 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	KRTAP10-8	P60410	259 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TTC21B-208	ENST00000497425	ZMYND11	Q15326	602 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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