RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	DIO3	P55073	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C21orf58	P58505	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PSPH	P78330	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MLC1	Q15049	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MAPK11	Q15759	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MAPK14	Q16539	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PGM2	Q96G03	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SORT1	Q99523	831 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		Q9N2J8	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		H7C1Q1	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	COPE	O14579	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RAMP1	O60894	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SEC22B	O75396	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C6orf47	O95873	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HEXA	P06865	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FGF4	P08620	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NEFH	P12036	1026 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	POU2F1	P14859	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MPI	P34949	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CPA2	P48052	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PTH2R	P49190	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OCRL	Q01968	901 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LTB	Q06643	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SKP2	Q13309	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DECR1	Q16698	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	IMPG1	Q17R60	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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