RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-208ENST00000495802 CFAP157Q5JU67 520 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ATL3Q6DD88 541 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 TMEM225Q6GV28 225 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ARCQ7LC44 396 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ALLCQ8N6M5 410 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR2L5Q8NG80 312 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 MARC2Q969Z3 335 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ZIM3Q96PE6 472 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PLEKHF1Q96S99 279 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 LRP5LA4QPB2 252 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 FAM231BA6NCW3 169 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 METTL21EPA6NDL7 271 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PRRG1O14668 218 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ZNF264O43296 627 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 RHOBTB1O94844 696 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 TIMP1P01033 207 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PNMTP11086 282 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 CD1EP15812 388 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 BTDP43251 543 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PLK1P53350 603 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 RIPK4P57078 832 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 CCDC173Q0VFZ6 552 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 EOGTQ5NDL2 527 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 TPGS2Q68CL5 300 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 CCDC80Q76M96 950 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 TMEM123Q8N131 208 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR56B4Q8NH76 319 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 NUS1Q96E22 293 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ZNF670Q9BS34 389 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 CD274Q9NZQ7 290 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PHF11Q9UIL8 331 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 KDRP35968 1356 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ARPC3O15145 178 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 CXCL13O43927 109 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR10H3O60404 316 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 IGHG4P01861 327 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 IMPDH1P20839 514 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 TDO2P48775 406 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 SPIBQ01892 262 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 C1orf61Q13536 156 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 BEND3Q5T5X7 828 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 CATSPER1Q8NEC5 780 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR2AP1Q8NGE2 309 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PIGCQ92535 297 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 RAPGEF5Q92565 580 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 TBX15Q96SF7 602 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 GAL3ST1Q99999 423 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR51J1Q9H342 316 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PDFQ9HBH1 243 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 LCMT1Q9UIC8 334 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 CELA1Q9UNI1 258 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 MEMO1Q9Y316 297 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 IFT52Q9Y366 437 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 TRDCB7Z8K6 153 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 F5H6K3 240 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 SPAG6O75602 509 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 MMP23AO75900 390 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 LGALS2P05162 132 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PRPHP41219 470 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 HNMTP50135 292 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 KLRC3Q07444 240 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR2L13Q8N349 312 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR52I1Q8NGK6 324 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 C7orf33Q8WU49 177 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 OR1E3Q8WZA6 343 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-208ENST00000495802 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms