RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492338.2

TNS1-218, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-218ENST00000492338 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 QPRTQ15274 297 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 VWA1Q6PCB0 445 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 EPGNQ6UW88 154 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 GGNQ86UU5 652 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 STK32CQ86UX6 486 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 ZNF563Q8TA94 476 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 POC1BQ8TC44 478 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 ARSGQ96EG1 525 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 MARK4Q96L34 752 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 OR52B2Q96RD2 323 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 INPP5KQ9BT40 448 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 RASSF1Q9NS23 344 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-218ENST00000492338 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 FAM234BA2RU67 622 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 SH3D21A4FU49 640 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 C16orf97H3BN30 126 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 HMGN4O00479 90 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 KIAA0513O60268 411 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 UGT2B17O75795 530 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 GOSR1O95249 250 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 H6PDO95479 791 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CD8BP10966 210 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 POU2F1P14859 743 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 PRKCAP17252 672 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 IL11P20809 199 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 RYKP34925 604 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CDKN2CP42773 168 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CRATP43155 626 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 SLC6A8P48029 635 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 PCYT1AP49585 367 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 KCNJ10P78508 379 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CHRNEQ04844 493 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 FAM27E3Q08E93 113 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 MERTKQ12866 999 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 SELENBP1Q13228 472 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 POU4F3Q15319 338 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ST8SIA1Q92185 356 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ADGRG7Q96K78 797 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 DOCK7Q96N67 2140 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 NPAS1Q99742 590 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CALML5Q9NZT1 146 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 HCFC1P51610 2035 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 PRKD3O94806 890 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ARAFP10398 606 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 TFPIP10646 304 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 UQCRBP14927 111 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 IL7RP16871 459 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 DNASE1P24855 282 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 GNALP38405 381 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 SESN3P58005 492 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 PPP2R2AP63151 447 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 SKP2Q13309 424 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 SYPL1Q16563 259 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 TTMPQ5BVD1 217 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 FRRS1Q6ZNA5 592 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 MAVSQ7Z434 540 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CDC20BQ86Y33 519 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 CMIPQ8IY22 773 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS1-218ENST00000492338 SLC43A2Q8N370 569 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms