RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 P2RY4P51582 365 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 FRA10AC1Q70Z53 315 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 RUFY3Q7L099 469 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 HPS6Q86YV9 775 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 NRMQ8IXM6 262 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 HAVCR1Q96D42 359 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 CHIAQ9BZP6 476 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 FANCFQ9NPI8 374 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL21Q9UJP4 597 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM28Q9UKQ2 775 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 COPS3Q9UNS2 423 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PQ72 361 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 TRDCB7Z8K6 153 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 FCMRO60667 390 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K8P41279 467 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA8P43361 318 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC15A2Q16348 729 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 COPS8Q99627 209 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 SNTNA6NMZ2 147 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8SH3BPF8 625 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 SERF1AO75920 110 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 IGLL1P15814 213 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 COX5AP20674 150 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 LEPP41159 167 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 EPS15P42566 896 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2L1Q07817 233 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 AANATQ16613 207 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 UTS2BQ765I0 119 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 SCFD1Q8WVM8 642 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 Q9H3A6 140 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 PFKFB2O60825 505 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN12O95859 305 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC166P0CW27 439 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 KLRB1Q12918 225 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0040Q15053 153 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf220Q5T0J3 134 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL17Q6UXB2 119 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 SKA3Q8IX90 412 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC65Q8IXS2 484 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 MRAPQ8TCY5 172 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 NT5C3BQ969T7 300 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 TPD52L3Q96J77 140 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 DEFB126Q9BYW3 111 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 POLE4Q9NR33 117 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 SEC14L3Q9UDX4 400 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 DCDC2Q9UHG0 476 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ATP10AO60312 1499 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 MED7O43513 233 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 SLITRK3O94933 977 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 DIRAS1O95057 198 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN9O95484 217 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 MX1P20591 662 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 GNA11P29992 359 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A2P50443 739 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 CDH4P55283 916 aa5.72□□□□□ -1.49
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