RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 CLDN20P56880 219 aa5.69□□□□□ -1.5
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PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF226Q9NYT6 803 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 DKKL1Q9UK85 242 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF40A-210ENST00000489741 TIMM22Q9Y584 194 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF40A-210ENST00000489741 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa5.67□□□□□ -1.5
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