RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 MUCL1Q96DR8 90 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TRMOQ9BU70 441 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OCEL1Q9H607 264 aa8.3□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.3□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5H1A6NKK0 313 aa8.29□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 COPEO14579 308 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 PIP5K1BO14986 540 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf47O95873 294 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CHEK2O96017 543 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TGFAP01135 160 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SHBGP04278 402 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CHRNGP07510 517 aa8.29□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 GGT1P19440 569 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV1-2P23083 117 aa8.29□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.29□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.29□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 PROX1Q92786 737 aa8.29□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5B2Q96R09 309 aa8.29□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM89A2RUT3 159 aa8.28□□□□□ -1.08
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SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM114B3SHH9 223 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF264O43296 627 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM13O60858 407 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJA2O60884 412 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 PGM3O95394 542 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-9P01782 118 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 KRT4P19013 534 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 DIO1P49895 249 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF83P51522 516 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 MERTKQ12866 999 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 CBFBQ13951 182 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 XKR7Q5GH72 579 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 B3GLCTQ6Y288 498 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SSX8Q7RTT4 187 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SFXN5Q8TD22 340 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ST8SIA1Q92185 356 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL8AQ96BM9 186 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 RADILQ96JH8 1075 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf50Q9BV19 199 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 VWFP04275 2813 aa8.28□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
SMARCE1-210ENST00000481231 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.27□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM157AC9JC47 383 aa8.27□□□□□ -1.09
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