RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	CADM2	Q8N3J6	435 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	MAL2	Q969L2	176 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SULT2B1	O00204	365 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CTAG2	O75638	210 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	GKN3P	P0CG01	181 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CD8B	P10966	210 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	NID1	P14543	1247 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ENPP1	P22413	925 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ATP4B	P51164	291 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	MVD	P53602	400 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SYT14P1	Q58G82	188 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	GRINA	Q7Z429	371 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CMIP	Q8IY22	773 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	FANCF	Q9NPI8	374 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0G2JPF8	293 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	C16orf97	H3BN30	126 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	PRKD3	O94806	890 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	NTN1	O95631	604 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	FES	P07332	822 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	AGTR1	P30556	359 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEA8	P43361	318 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	DIO1	P49895	249 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	OR2B6	P58173	313 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	COPZ1	P61923	177 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	FADD	Q13158	208 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	RNF128	Q8TEB7	428 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	RASSF1	Q9NS23	344 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	VAPA	Q9P0L0	249 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PP18	115 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CGA	P01215	116 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CD1E	P15812	388 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CXCR1	P25024	350 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	TACR3	P29371	465 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	UGT2B10	P36537	528 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	HTR3A	P46098	478 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	RAC3	P60763	192 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK11	Q15759	364 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SLC43A2	Q8N370	569 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	BBS10	Q8TAM1	723 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	PMM1	Q92871	262 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	DDIT4L	Q96D03	193 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	DACH2	Q96NX9	599 aa		13.21	□□□□□ -0.29

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