RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, human

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM3-215	ENST00000469717	LGALS3BP	Q08380	585 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	GPM6B	Q13491	265 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TP53I3	Q53FA7	332 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	DOK4	Q8TEW6	326 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	OR14A2	Q96R54	314 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	INSL6	Q9Y581	213 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	ZNF197	O14709	1029 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	KCNAB3	O43448	404 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	HP	P00738	406 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	GALT	P07902	379 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	SORD	Q00796	357 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TNFRSF17	Q02223	184 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TSPAN31	Q12999	210 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PLA2G7	Q13093	441 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	THEM6	Q8WUY1	208 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	RFK	Q969G6	155 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	FBXO17	Q96EF6	278 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	ZNF75A	Q96N20	296 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PBX4	Q9BYU1	374 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	OPN4	Q9UHM6	478 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PRSS44	E7EML9	344 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717		H7C2Y5	167 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PCDH8	O95206	1070 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	WDPCP	O95876	746 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	EOMES	O95936	686 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	SFTPC	P11686	197 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PSMB5	P28074	263 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	SMIM11A	P58511	58 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	FXYD6P3	P58550	94 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	DUSP2	Q05923	314 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	LMAN2	Q12907	356 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	AGER	Q15109	404 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	ZNF124	Q15973	351 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	DPH1	Q9BZG8	443 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	CWH43	Q9H720	699 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	GLS2	Q9UI32	602 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717		J3QRE1	110 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	GOSR2	O14653	212 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	T	O15178	435 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	AKR7A3	O95154	331 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TGM6	O95932	706 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	SERPIND1	P05546	499 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PCSK2	P16519	638 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	LAG3	P18627	525 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PPM1A	P35813	382 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	CAP1	Q01518	475 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	FGL1	Q08830	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	NDUFA9	Q16795	377 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717		Q6ZVU0	165 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	NSMAF	Q92636	917 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	GAL3ST1	Q99999	423 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	UBQLN3	Q9H347	655 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM3-215	ENST00000469717	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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