RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 AHSGP02765 367 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 RPN2P04844 631 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ABHD2P08910 425 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2T7P0C7T2 308 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 THRBP10828 461 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PSKH1P11801 424 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 UQCRBP14927 111 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 CD1EP15812 388 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 UGT2B7P16662 529 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SPI1P17947 270 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 MAGP20916 626 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 FDXRP22570 491 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 NR4A1P22736 598 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SSTR1P30872 391 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 NR4A2P43354 598 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB28P51157 221 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TGM3Q08188 693 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SCGB2A2Q13296 93 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 MADCAM1Q13477 382 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 KRT33BQ14525 404 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 IL11RAQ14626 422 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF846Q147U1 533 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 LCN10Q6JVE6 187 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SPESP1Q6UW49 350 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PLD3Q8IV08 490 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 CADM2Q8N3J6 435 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 MEIOBQ8N635 442 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 HMGCLL1Q8TB92 370 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 MR1Q95460 341 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 IL17FQ96PD4 163 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2A14Q96R47 310 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SOX7Q9BT81 388 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TMED9Q9BVK6 235 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 LDAHQ9H6V9 325 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 GPAMQ9HCL2 828 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 MIOXQ9UGB7 285 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 MED13LQ71F56 2210 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 A6NIZ1 184 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM159BA6NKW6 160 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 H7C2Y5 167 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 GFYI3L273 518 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 VPS26AO75436 327 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PIAS1O75925 651 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TNFAIP8O95379 198 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 TNFRSF6BO95407 300 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 YES1P07947 543 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 EBLN1P0CF75 366 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 MPC1LP0DKB6 136 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PEPDP12955 493 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PVRP15151 417 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 FOLR1P15328 257 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ST6GAL1P15907 406 aa6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RPUSD3-212ENST00000466141 PCSK6P29122 969 aa6.74□□□□□ -1.33
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