RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 FREM1Q5H8C1 2179 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CDHR4A6H8M9 788 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CFAP73A6NFT4 308 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 A8MXE2 369 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 FAAHO00519 579 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 NUDT7P0C024 238 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 ARAFP10398 606 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 GPX2P18283 190 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-205ENST00000466097 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
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SH3BP1-205ENST00000466097 FANCFQ9NPI8 374 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 RLIMQ9NVW2 624 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 CRIM1Q9NZV1 1036 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 CLEC4AQ9UMR7 237 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP1-205ENST00000466097 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa13.18□□□□□ -0.3
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SH3BP1-205ENST00000466097 PRKD3O94806 890 aa13.18□□□□□ -0.3
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