RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SOCS6O14544 535 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ARPC3O15145 178 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 YKT6O15498 198 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SIGLEC6O43699 453 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FADS1O60427 444 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HCN1O60741 890 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPB7O75200 414 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DKK1O94907 266 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 UTS2O95399 124 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TIAF1O95411 115 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HMGN1P05114 100 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 VSIG8P0DPA2 414 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CKMT1AP12532 417 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IFI30P13284 250 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SOX3P41225 446 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC1A3P43003 542 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SEPHS1P49903 392 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 WNT4P56705 351 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DCAF7P61962 342 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BDH1Q02338 343 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EGR4Q05215 589 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GGTLC2Q14390 218 aa5.17□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 VWA2Q5GFL6 755 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ULK3Q6PHR2 472 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CBLN3Q6UW01 205 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 USP43Q70EL4 1123 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RABEPKQ7Z6M1 372 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC190Q86UF4 302 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf74Q86VG3 221 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GATAD2AQ86YP4 633 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BMPERQ8N8U9 685 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EXD3Q8N9H8 876 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC75AQ8NAA5 344 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KBTBD8Q8NFY9 601 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR52N1Q8NH53 320 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FANK1Q8TC84 345 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LRFN5Q96NI6 719 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MED18Q9BUE0 208 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MND1Q9BWT6 205 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PRRG3Q9BZD7 231 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MMP27Q9H306 513 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM27Q9HBJ8 222 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 UBQLN4Q9NRR5 601 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 QPCTLQ9NXS2 382 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CTSFQ9UBX1 484 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SUSD2Q9UGT4 822 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL3Q9UH77 587 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BAIAP2Q9UQB8 552 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CARD8Q9Y2G2 431 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MED31Q9Y3C7 131 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MUC3AQ02505 3323 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35F4A4IF30 521 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ALG1L2C9J202 215 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 M0R3G1 203 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 WWP2O00308 870 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR7A10O76100 309 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RCBTB2O95199 551 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 WISP1O95388 367 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TXNDC12O95881 172 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CH25HO95992 272 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CSTAP01040 98 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CYC1P08574 325 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FGF5P12034 268 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PEPDP12955 493 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF12P17014 697 aa5.16□□□□□ -1.58
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