RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM2Q9C040 744 aa7.47□□□□□ -1.21
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR51I1Q9H343 314 aa7.47□□□□□ -1.21
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.47□□□□□ -1.21
GAPDHP28-201ENST00000455134 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.47□□□□□ -1.21
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAO1Q9UJM8 370 aa7.47□□□□□ -1.21
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBN3Q75N90 2809 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 GJE1A6NN92 205 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF724A8MTY0 619 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFLARO15519 480 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 STX11O75558 287 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSTAP01040 98 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV4-39P01824 125 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 FESP07332 822 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 GUSBP08236 651 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR12D1P0DN82 309 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL32P24001 234 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCR4P51679 360 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 P2RY6Q15077 328 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAPK11Q15759 364 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PGS1Q32NB8 556 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYT14P1Q58G82 188 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 DTX2Q86UW9 622 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXW5Q969U6 566 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TESCQ96BS2 214 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZIM3Q96PE6 472 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5B2Q96R09 309 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 FANCFQ9NPI8 374 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIGARQ9NQ88 270 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACER3Q9NUN7 267 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.46□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR91A4D1P6 747 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUXAA6NLW8 204 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF223E7ERA6 249 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3BNH8 94 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDLIM1O00151 329 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMGN4O00479 90 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 AP3D1O14617 1153 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLOCKO15516 846 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 AK1P00568 194 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINE1P05121 402 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD3EP07766 207 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 UQCRC2P22695 453 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL12AP29459 219 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC7A1P30825 629 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACVR1BP36896 505 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3F3AP84243 136 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A3Q00325 362 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRNEQ04844 493 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPOCK1Q08629 439 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MERTKQ12866 999 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHI3L2Q15782 390 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR93Q6P2C0 686 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 EMBQ6PCB8 327 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MREGQ8N565 214 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSD17B8Q92506 261 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ROPN1LQ96C74 230 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEURL3Q96EH8 262 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms