RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ZFP57Q9NU63 452 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 TDP1Q9NUW8 608 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 MCIDASD6RGH6 385 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 E9PI62 339 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 PLPP1O14494 284 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 NOS3P29474 1203 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 P2RX1P51575 399 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 TAS2R41P59536 307 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ACTA2P62736 377 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ACTG2P63267 376 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 RNF212Q495C1 297 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 KRT78Q8N1N4 520 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 SEC11CQ9BY50 192 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 LINC00587B1AMM8 73 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 H7BY64 318 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 H7C4K7 107 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 THY1P04216 161 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 FABP1P07148 127 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 CD79AP11912 226 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 FXYD6P3P58550 94 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 AVPI1Q5T686 147 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 OR51G2Q8NGK0 314 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 RAB8BQ92930 207 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 MIB2Q96AX9 1013 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 MED8Q96G25 268 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 TEX101Q9BY14 249 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 C5orf52A6NGY3 159 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 IFITM5A6NNB3 132 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ZNF879B4DU55 563 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ADCYAP1P18509 176 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 TEX30Q5JUR7 227 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 TSSK4Q6SA08 328 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ARL9Q6T311 187 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 CD99L2Q8TCZ2 262 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 CHIAQ9BZP6 476 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 MFFQ9GZY8 342 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 LHX9Q9NQ69 397 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 CNIH4Q9P003 139 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 HS3ST2Q9Y278 367 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 F8VVB4 439 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 F8VWA3 439 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 H7C417 338 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 TBL1XO60907 577 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 IGHV2-70P01814 119 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 FGBP02675 491 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 CSF1P09603 554 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 S100PP25815 95 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 CTGFP29279 349 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 NAAAQ02083 359 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 VWA2Q5GFL6 755 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-208ENST00000441439 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms