RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SAMD12Q8N8I0 201 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 RDH12Q96NR8 316 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TNFRSF10AO00220 468 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 AVPR2P30518 371 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PCGF2P35227 344 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SELENOWP63302 87 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PRR7Q8TB68 274 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 THAP6Q8TBB0 222 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ABCG2Q9UNQ0 655 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ADAP00813 363 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CTSLP07711 333 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MAGEA12P43365 314 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 RPL19P84098 196 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 KMT5CQ86Y97 462 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 NDNFQ8TB73 568 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CCDC115Q96NT0 180 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 FEVQ99581 238 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PMS2P1A4D2B8 440 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SLCO2B1O94956 709 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SERPINA5P05154 406 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 BIDP55957 195 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZNB5 142 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 AKAP14Q86UN6 197 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 DTX3Q8N9I9 347 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 POGLUT1Q8NBL1 392 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MAGIXQ9H6Y5 334 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TJP1Q07157 1748 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 H7C417 338 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MPIG6BO95866 241 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ATP1B3P54709 279 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CPOQ8IVL8 374 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 OR9Q2Q8NGE9 314 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 QPCTLQ9NXS2 382 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 RNF6Q9Y252 685 aa11.25□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TOR1AO14656 332 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CYB5BO43169 146 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 RETP07949 1114 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 FXYD4P59646 89 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZNF675Q8TD23 568 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 WACQ9BTA9 647 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 P2RY12Q9H244 342 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MTNR1AP48039 350 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 HES1Q14469 280 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TMEM236Q5W0B7 351 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ABHD17CQ6PCB6 329 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PRRC1Q96M27 445 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 DPAGT1Q9H3H5 408 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CMAHPQ9Y471 501 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 LRRN3E7EW58 273 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ALDOBP05062 364 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZBED5Q49AG3 693 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 S100PBPQ96BU1 408 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 EGLN2Q96KS0 407 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 A0A1B0GVC2 190 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 A0A1W2PPH5 198 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MEN1O00255 615 aa11.24□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 HRO43593 1189 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms