RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BTBD2Q9BX70 525 aa14.38□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.38□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.38□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDPK1O15530 556 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OIP5O43482 229 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC16A1P53985 500 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBFBQ13951 182 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 QPRTQ15274 297 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.37□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERTM1A2A2V5 107 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A8MT66 165 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNPH1O43598 174 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUPT7LO94864 414 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFP02787 698 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NTF4P34130 210 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGEA4P43358 317 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HTR6P50406 440 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYT14P1Q58G82 188 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASP12Q6UXS9 341 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR51F2Q8NH61 342 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST8SIA1Q92185 356 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JADE3Q92613 823 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPH5Q9H2P9 285 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARMCX1Q9P291 453 aa14.36□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF264O43296 627 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL10O95999 233 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNPP00491 289 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ENO1P06733 434 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HKR1P10072 659 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPGP29372 298 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGEA8P43361 318 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VHLLQ6RSH7 139 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BOD1Q96IK1 185 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STACQ99469 402 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERP44Q9BS26 406 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GIN1Q9NXP7 522 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMS2P2O95744 297 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCR4P51679 360 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP12AP54707 1039 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CREG2Q8IUH2 290 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUP37Q8NFH4 326 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM234Q8WY98 164 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF524Q96C55 264 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DOK1Q99704 481 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIGUQ9H490 435 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VWFP04275 2813 aa14.34□□□□□ -0.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLF11O14901 512 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFPIP10646 304 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBL4AP11441 157 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPR2P20594 1047 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGEA12P43365 314 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKNOX1P55347 436 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL1RL1Q01638 556 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GUCY2DQ02846 1103 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAV1Q03135 178 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MERTKQ12866 999 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADRM1Q16186 407 aa14.33□□□□□ -0.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OCLNQ16625 522 aa14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms