RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SRYQ05066 204 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 RGS1Q08116 209 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGAP19Q14CB8 494 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 KLHL38Q2WGJ6 581 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 C6orf52Q5T4I8 152 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 LIPNQ5VXI9 398 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SLC22A10Q63ZE4 541 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 OPN5Q6U736 354 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 HSDL2Q6YN16 418 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 IL17RELQ6ZVW7 336 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF550Q7Z398 422 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 C17orf64Q86WR6 236 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 TIGD4Q8IY51 512 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 C10orf53Q8N6V4 93 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF740Q8NDX6 193 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PANX2Q96RD6 677 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PKP4Q99569 1192 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 OR8D2Q9GZM6 311 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SH2D2AQ9NP31 389 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 HAO2Q9NYQ3 351 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 UQCRHLA0A096LP55 91 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CD8B2A6NJW9 211 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 E5RI56 91 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 OR1F1O43749 312 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 GPRIN2O60269 458 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 NIPSNAP2O75323 286 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 ERGP11308 486 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CDH1P12830 882 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 EDN2P20800 178 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 PSMA3P25788 255 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 DPP4P27487 766 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PCGF2P35227 344 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CDKN1AP38936 164 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 TTPAP49638 278 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CAPZA1P52907 286 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CASP9P55211 416 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 RAB8AP61006 207 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 RELAQ04206 551 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ASPHQ12797 758 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF273Q14593 569 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 TBC1D19Q8N5T2 526 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM18Q96B42 140 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF597Q96LX8 424 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 QRFPRQ96P65 431 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CDRT15Q96T59 188 aa4.05□□□□□ -1.76
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