RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396352.8

HOXA3-202, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA3, Length 3,263 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-202ENST00000396352 A0A1W2PPK0 400 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 LRRC72A6NJI9 287 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 TFP02787 698 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 SYPP08247 313 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ANXA3P12429 323 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 SDHBP21912 280 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CCR6P51684 374 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 TP53I3Q53FA7 332 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ESCO2Q56NI9 601 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF613Q6PF04 617 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CDRT4Q8N9R6 151 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 STACQ99469 402 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 DIABLOQ9NR28 239 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 A0A087WV62 115 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 A0A1W2PQ72 361 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 FGF17O60258 216 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 BRINP1O60477 761 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ADAM11O75078 769 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 PEPDP12955 493 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ARL14Q8N4G2 192 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 OR2M4Q96R27 311 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 IL21RQ9HBE5 538 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 DPP7Q9UHL4 492 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 OGG1O15527 345 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ICMTO60725 284 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 NT5EP21589 574 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CAPZA2P47755 286 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 GSG1Q2KHT4 349 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 FCRL6Q6DN72 434 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 THAP4Q8WY91 577 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 PELI1Q96FA3 418 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF426Q9BUY5 554 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CT62P0C5K7 136 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 DRD5P21918 477 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 MGAT2Q10469 447 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 POU4F2Q12837 409 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 SMIM19Q96E16 107 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF559Q9BR84 538 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 COPZ2Q9P299 210 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 TPOP07202 933 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CDK5R1Q15078 307 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ST3GAL2Q16842 350 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 HGDQ93099 445 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 BRD7Q9NPI1 651 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 OBP2AQ9NY56 170 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 TNFSF14O43557 240 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 SLC22A5O76082 557 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 MT-ND4P03905 459 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 UCHL1P09936 223 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 NUDT1P36639 197 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 PITPNAQ00169 270 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 CMIPQ8IY22 773 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXA3-202ENST00000396352 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms